“目前，绝大部分中药材种子种苗没有质量标准，门槛低。”许淑清建议，有必要利用科学的手段制定并强化执行种子种苗质量标准，提高药用植物发芽率、成活率、开花率等指标，提高质量和产量。
我国在繁殖选种、杂交育种、基因工程育种、太空育种等技术已取得许多重大成就。应利用这些先进的技术，培育高产、稳产、优质，具有多抗性、有效成分高的药用品种，这样的品种能够减少农药的使用量，节约成本并减少农药残留超标。
许多中草药不能重茬种植，如桔梗、三七、西洋参、人参等。这会导致这些中药材长势减弱，产量、品质、抗病能力明显降低。对于那些“道地性”很强，对生长环境要求高，适合种植的区域小的药材如人参、三七的可持续发展尤其不利。对此，许淑清建议，应利用现代科技手段分析土壤理化性状恶化、营养失衡、土壤有益微生物和有益酶类减少等因素，从不同角度对重茬障碍机制进行深入研究，解决中药材重茬种植问题。
此外，中药材农药残留问题一直被各界广泛关注。部分药农种植地区选址不当，土壤或水源存在重金属污染，种植阶段为了快速防治病虫害，盲目使用高毒禁用农药品种，导致中药材农药残留、重金属超标问题。
针对这些问题，许淑清建议，首先在种植之前，应用先进的检测手段，对种植土壤和水质资源进行检测，选择合适的种植区域，同时在药用植物领域引入植物病理学和昆虫学知识，积极推广农业防治、物理防治、生物防治等综合防治措施，将各种病虫害防治技术有机结合，形成一个科学的防治体系，减少用药的使用量，保证药材的品质。
许淑清还建议，必须严格执行科学合理的中药材采收标准，提高中药材的质量。她说，有句话叫做“三月茵陈四月蒿，五月砍来当柴烧。”药材该采收时不采收，不该采收时乱采收，会使中药材质量出现滑坡。根茎类药材应该在花开前或花谢后采收，有的药农却在花期采收，结果上市后连专家都认不出来。有的农民看时价不好，就把药材留在地里继续生长，等着涨价，但像板蓝根、白芷、当归一类药，当年不收就开花抽薹，做药用的根就严重木质化，药效降低。
此外，还应制订科学合理、要求更高的中药材质量标准。
